蚂蚁男孩佩尔比以往任何时候都受人关注,他打败了仇敌“跳蚤”,现在跳蚤被关进了一家研究所的监狱里。佩尔转眼13岁了,他也已经习惯了超级英雄的身份。在理想状态中,佩尔的搭档艾达会是他的女友,但现实的情况是复杂的,艾达现在有一个意想不到的对手那就是学校里一个小男孩,这个小男孩独来独往,他不仅不断阻止艾达接近佩尔,而且还是一位比跳蚤还要厉害的对手。更可怕的是,佩尔逐渐发现自己被控制,但是现在他遇到了一个新的也更强大的敌人,敌人有隐身的技能,难以琢磨,经常使他陷入困境之中,此时,一个超级大反派也宣布到来,佩尔面